Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 LINC01320-214ENST00000627935 916 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CDY4P-201ENST00000418290 1513 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TNIK-210ENST00000470834 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PTBP2-203ENST00000426398 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC090061.1-202ENST00000502102 1449 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ENOX2-207ENST00000610637 2422 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 HSPA8P6-201ENST00000451965 1552 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ABCB1-211ENST00000622132 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KCNJ15-221ENST00000613499 3049 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ALDH1A1-201ENST00000297785 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PLEKHS1-203ENST00000369309 2534 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GLYATL2-201ENST00000287275 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP003086.1-201ENST00000513207 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 UNC79-201ENST00000256339 8400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF192P2-201ENST00000402215 1383 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF559-211ENST00000592504 1398 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LIMCH1-216ENST00000512820 5071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TBC1D31-202ENST00000327098 2985 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GFRAL-201ENST00000340465 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MARK3-203ENST00000335102 2331 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 FRG2B-202ENST00000443774 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PAXIP1-AS2-201ENST00000397551 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 CLLU1OS-201ENST00000378487 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 GRB10-207ENST00000402578 4760 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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PTGFRP43088 NLRP3-206ENST00000391828 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SYNPR-201ENST00000295894 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CPA4-201ENST00000222482 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NBPF19-204ENST00000611931 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NBPF14-205ENST00000614329 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NBPF26-205ENST00000615219 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NBPF14-207ENST00000616120 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NBPF12-207ENST00000617864 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NBPF20-204ENST00000620821 2051 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AMBN-202ENST00000449493 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 VPS4B-201ENST00000238497 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MASP1-205ENST00000392472 3900 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SLC24A2-201ENST00000286344 2170 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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