Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GTF3C3Q9Y5Q9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms