Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRELID3BQ9Y3B1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRELID3BQ9Y3B1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms