Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP11Q9Y3A2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP11Q9Y3A2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms