Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RNF6Q9Y252 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RNF6Q9Y252 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms