Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PNMA8BQ9ULN7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PNMA8BQ9ULN7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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