Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms