Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FBXL4Q9UKA2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms