Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2IRD1Q9UHL9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2IRD1Q9UHL9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms