Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

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Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHD7Q9P2D1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHD7Q9P2D1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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