Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNTN3Q9P232 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNTN3Q9P232 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms