Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHMP5Q9NZZ3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHMP5Q9NZZ3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms