Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ABCF3Q9NUQ8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ABCF3Q9NUQ8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms