Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATG3Q9NT62 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms