Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SAMSN1Q9NSI8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAMSN1Q9NSI8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms