Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KCNIP2Q9NS61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms