Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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