Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP85

NPHS2, Podocin, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHS2Q9NP85 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NPHS2Q9NP85 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NPHS2Q9NP85 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NPHS2Q9NP85 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms