Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APOBEC3GQ9HC16 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3GQ9HC16 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms