Protein–RNA interactions for Protein: Q9H467

CUEDC2, CUE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUEDC2Q9H467 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUEDC2Q9H467 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUEDC2Q9H467 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms