Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMG9Q9H0W8 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMG9Q9H0W8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms