Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
AMBRA1Q9C0C7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
AMBRA1Q9C0C7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms