Protein–RNA interactions for Protein: Q9C093

SPEF2, Sperm flagellar protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF2Q9C093 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPEF2Q9C093 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPEF2Q9C093 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms