Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM6Q9C030 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms