Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
YTHDF1Q9BYJ9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
YTHDF1Q9BYJ9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms