Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SNHG12Q9BXW3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms