Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LSM14BQ9BX40 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LSM14BQ9BX40 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms