Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf16Q9BUW7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms