Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSEN34Q9BSV6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSEN34Q9BSV6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms