Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LARP6Q9BRS8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LARP6Q9BRS8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms