Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC77Q9BR77 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC77Q9BR77 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms