Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CITED2Q99967 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms