Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MMP19Q99542 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP19Q99542 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms