Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CITED4Q96RK1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CITED4Q96RK1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms