Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC4A9Q96Q91 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms