Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ALS2Q96Q42 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ALS2Q96Q42 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms