Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227BQ96M60 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms