Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NBPF4Q96M43 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NBPF4Q96M43 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms