Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNX27Q96L92 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX27Q96L92 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms