Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
LTV1Q96GA3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LTV1Q96GA3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms