Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BICD1Q96G01 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BICD1Q96G01 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms