Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RNFT2Q96EX2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RNFT2Q96EX2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms