Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC47Q96A33 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms