Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MKL1Q969V6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MKL1Q969V6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms