Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CAVIN3Q969G5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms