Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GATAD2BQ8WXI9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms