Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHIPQ8WWQ0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms