Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOBEC4Q8WW27 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOBEC4Q8WW27 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms