Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDAC7Q8WUI4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDAC7Q8WUI4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms