Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSKUQ8WUA8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms